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対話型分子動力学を試してみませんか?

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※システムに不具合が生じても一切責任は負いません!!
「s」のキーで何が出るかな?

研究活動に必要な各種文書、ソフトウェアコード、リンク先などを列記します。
(齋藤, updated at 2020/6/2)

英語輪読情報 こちらへ

電子文書等(パスワード制限あり)

  1. 分子動力学法の基礎とプログラミング[PDF]
  2. 初級分子動力学法 [PDF] [pptプレゼン(PDF)[サンプルプログラム][サンプルプログラム(フォートラン)]
  3. Linuxあれこれ研究室版 [PDF]2015バージョン
  4. Linuxについて(啓蒙用)[PDF]
  5. 計算力学の基礎の基礎 [PDF(作成中)]
  6. PovRay(コンピュータグラフィックスソフト)指南[PDF]
  7. AFM(原子間力顕微鏡)マニュアル[PDF(準備中)]
  8. インテルフォートラン、数学ライブラリ、構造解析ソフト、グラフソフトのインストール法[PDF(準備中)]
  9. 第一原理ソフトのインストール法[PDF(準備中)]
  10. 各種技術・研究レポート/メモ [リスト]
  11. MD分野でのMicroAVS利用事例 [ウェブ]
  12. MicroAVSを教育に利用するセミナー(理科教材素材流通サーバー提供)[講義ビデオ]
  13. ナノmemm計算システム2009の説明[PDF]
  14. ナノ サーバー配置(案)の説明[PDF]
  15. OpenMPと並列化の導入[PDF]
  16. MDにおける正規化[PDF]
  17. Gnuplotによる3次元グラフ[PDF]
  18. 計算力学研究の流れ[PDF]2014New
  19. ナノ班サーバーの事(計算フロー)[PDF] 2019up
  20. おはじめLammps[PDF] 2019New [サンプルデータ] 2020New

    ソフトウェアコード(パスワード制限あり)

    1. LJのMDコード [Al]
    2. EAMのMDコード[FS | 鉄FS | (Cu)Mishin et al. | 合金(Al)Mishin+せん断]
    3. EMTのMDコード [Cu]
    4. 固体のSPHコード [弾性][塑性][弾塑性(ひずみ増分型)] [2D弾性(旧)]
    5. 対話型MDコード [FS | カーボン]
    6. カーボンのMDコード[Brenner1]
    7. SiCのMDコード [Tersoff]
    8. Polymer(polyethylene) MD code [POLY]
    9. Parrinello-Rahman MD code [prmd]
    10. MD用結晶粒界作成プログラム [mkgb]
    11. MD用原子構造作成プログラム [smkcryst.gb (粒界版)] [smkcryst(旧版)]
    12. 多項式近似プログラム[polynominal]
    13. MishinのアルミニウムEAMのMDコード(3次スプラインおよびひずみ制御MD付!) [almishin ver.4.0(垂直ひずみ)] [almishin ver 5.1(せん断ひずみ,7/11更新済み)]
    14. 共通原子解析(CNA/TMRO)コード(fcc,hcp,bccの判別可能) [honeycutt-f20](Vアップfrom V1.0(2002)) [bccのCNA解説図]
    15. Wien2k [クイックスタート和訳PDF] [クイックスタート和訳MSDOC][使用メモ]
    16. Xcrysdens(wien2k用可視化) [使用方法]
    17. CSP(Centrosymmetry Parameter)解析[csp-v10]
    18. DPD(散逸動力学)のプログラム基本バージョン[dpd-ver10]
    19. 粒界など生成プログラム・新(ダイヤモンド構造対応あり;ボロノイ分割利用)[cstruct-ver09]

    リンク

    1. WIEN2000
    2. LAMMPS(Sandia)
    3. MicroAVS | VizJournal (Cybernet:旧KGT)
    4. DLPOLY
    5. GROMACS
    6. NAMD
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    講義・演習のリソースはここです。
    (齋藤)

    講義

    演習

    • 機械工学入門(実技)
    • 機械工学入門(講義:機械のしくみ)
    • 機械総合実験
    • 特別研究

    情報(リンク)


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